Rawat inap merupakan salah satu layanan yang terdapat di RSI Sultan Agung Banjarbaru. Kamar maupun ruangan yang disediakan beragam sesuai kebutuhan pasien, mulai dari kamar kelas VVIP, VIP, Kelas 1, Kelas 2, Kelas 3, dan Kamar Bayi, hingga ruangan ICU / ICCU / HCU yang berfungsi untuk memberikan perawatan khusus pada penderita yang memerlukan perawatan yang lebih intensif, juga ruangan Perinatologi / NICU / PICU yang merupakan ruang rawat inap bagi bayi - bayi baru lahir yang membutuhkan perawatan khusus di Rumah Saki